O SIGGQ integra um conjunto de processos interrelacionados − monitorizados e avaliados por indicadores adequados à medição da concretização de objetivos – que se subdividem em quatro tipos:
Processo de Gestão Estratégica: define as políticas de desenvolvimento e melhoria contínua.
Processos Principais: enquadram as atividades desenvolvidas áreas de: Ensino e Aprendizagem; I&D; Colaboração Interinstitucional e com a Comunidade; Internacionalização.
Processos de Suporte: suportam os processos principais (Recursos Humanos; Recursos Materiais e Serviços; Gestão da Informação; Informação Pública).
Processo de Revisão e Melhoria Contínua do SIGGQ: avalia a eficácia e eficiência do sistema.